Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCTP09848 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCTP09848 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCTP09848 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LCTP09848 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCTP09848 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCTP09848 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCTP09848 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCTP09848 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCTP09848 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms