Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLTAP09496 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLTAP09496 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLTAP09496 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLTAP09496 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms