Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms