Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NGFRP08138 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NGFRP08138 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NGFRP08138 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NGFRP08138 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms