Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC3P02656 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms