Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN7O95471 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLDN7O95471 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms