Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX3O75364 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX3O75364 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX3O75364 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX3O75364 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX3O75364 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX3O75364 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX3O75364 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms