Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUTAO60888 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUTAO60888 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUTAO60888 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUTAO60888 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUTAO60888 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUTAO60888 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUTAO60888 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUTAO60888 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUTAO60888 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms