Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH6O60337 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH6O60337 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms