Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DYNC1LI2O43237 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DYNC1LI2O43237 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms