Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3EO15041 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms