Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRTO14522 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRTO14522 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRTO14522 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
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