Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
O00370 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
O00370 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
O00370 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
O00370 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
O00370 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms