Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC00853-201ENST00000429328 661 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL592182.2-201ENST00000442477 858 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC025465.1-201ENST00000503145 797 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 HNRNPA1P67-201ENST00000604027 926 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 FMO10P-201ENST00000455032 1493 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 RAB11A-209ENST00000569896 1396 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 DNAAF4-203ENST00000448430 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 AC007848.1-201ENST00000538430 1405 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PDK4Q16654 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
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PDK4Q16654 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TSSK4-201ENST00000287913 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AP001342.1-201ENST00000423389 525 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL391361.2-202ENST00000454826 439 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 C8orf87-201ENST00000521906 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PDK4Q16654 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 B4GALT6-203ENST00000383131 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 AL031282.1-204ENST00000418950 497 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PDK4Q16654 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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