Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.76■■□□□ 1.56
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms