Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms