Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BARX2Q9UMQ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms