Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC24A2Q9UI40 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms