Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH10Q9P2E7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms