Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAMSAP3Q9P1Y5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms