Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms