Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
INCENPQ9NQS7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms