Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FZD3Q9NPG1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms