Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6CQ9HCJ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms