Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
YTHDC2Q9H6S0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
YTHDC2Q9H6S0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC2Q9H6S0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms