Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC22A4Q9H015 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms