Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD1Q9GZZ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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