Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN1Q9GZU1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms