Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZC3H12CQ9C0D7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZC3H12CQ9C0D7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms