Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAPERQ9BY12 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms