Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHP1Q99653 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHP1Q99653 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms