Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TGS1Q96RS0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms