Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCMTD1Q96MG8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms