Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00477Q96M19 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00477Q96M19 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00477Q96M19 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00477Q96M19 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00477Q96M19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00477Q96M19 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms