Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC17Q96LX7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC17Q96LX7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms