Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGCZQ96LD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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