Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms