Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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CHCHD4Q8N4Q1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CHCHD4Q8N4Q1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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