Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD4Q8IYR2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD4Q8IYR2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms