Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLF2Q8IX21 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLF2Q8IX21 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms