Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME9Q86XW9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME9Q86XW9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NME9Q86XW9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NME9Q86XW9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME9Q86XW9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms