Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL8

Putative uncharacterized protein FLJ42384, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZVL8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6ZVL8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms