Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms