Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPPQ6IPU0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms