Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUD7BQ6GQQ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms