Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CARMIL2Q6F5E8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL2Q6F5E8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms