Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC30Q5VVM6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC30Q5VVM6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC30Q5VVM6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms