Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE4DIPQ5VU43 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE4DIPQ5VU43 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms