Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
OBSCNQ5VST9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms