Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COBLL1Q53SF7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms